Începând cu data de 30 octombrie 2017, instanța şi-a mutat sediul într-un imobil nou, după ce a funcţionat mult timp într-un spaţiu inadecvat atât ca situare, mărime, cât şi ca funcţionalitate. Activitatea Tribunalului Militar Iaşi, se desfăşoară în temeiul Legii nr. 304/2004 privind organizarea judiciară şi a Legii nr. 303/2004 privind statutul magistraţilor, precum şi în baza Regulamentului de ordine interioară al instanţelor aprobat prin Hotărârea Consiliului Superior al Magistraturii nr. 1373/2015.
Instanţă fără personalitate juridică, cu competenţă materială de rangul judecătoriei până la data de 01.02.2014 când, în temeiul noului Cod de procedură penală şi a Legii nr.255/2013 de punere în aplicare a acestuia, trece la rangul profesional de tribunal, Tribunalul Militar Iaşi are competenţă teritorială pe limita a opt judeţe, respectiv – Botoşani, Suceava, Neamţ, Vaslui, Iaşi, Bacău, Vrancea şi Galaţi.